Covid-19

Gen-COVID

Working on COVID-19 since January 2020, at the time of our kick-off meeting in Brussels related to our European project DIAMONDS on infectious diseases.

Our web-site is open since already a few months: GEN-COVID. Please, visit it and have a look at the different areas we are working with on COVID-19. A brief summary:

OMICS on the host:

Genomics. Genetic markers of susceptibility and prognosis of COVID-19 infection
Transcriptomics. Local and systemic transcriptomic signatures that allow the accurate differential diagnosis of COVID-19 infection at different timepoints of infection, as well as establish prognostic markers for its natural history. Differential expression patterns in different host samples
Epigenomics. Understanding the role of epigenomics in COVI-19
Proteomics. Patterns in different host samples and at different stages of the infection

Inmunology. Soluble biomarkers related to the immune system that allow us to characterize and predictthe immune response to COVID-19

OMICS on the pathogene. Understanding genome variation of CoV-2

CRISPR experiments on diagnosis and detection of the pathogene

Publications of the group related to COVID-19/SARS-CoV-2

Bello X, Pardo-Seco J, Gomez-Carballa A, Weissensteiner H, Martinon-Torres F, Salas A. 2022. CovidPhy: A tool for phylogeographic analysis of SARS-CoV-2 variation. Environ Res 204: 111909.
Dacosta-Urbieta A, Rivero-Calle I, Pardo-Seco J, Redondo-Collazo L, Salas A, Gomez-Rial J, Martinon-Torres F. 2020. Seroprevalence of SARS-CoV-2 Among Pediatric Healthcare Workers in Spain. Front Pediatr 8: 547.
Gómez-Carballa A, Bello X, Pardo-Seco J, Martinón-Torres F, Salas A. 2020a. Mapping genome variation of SARS-CoV-2 worldwide highlights the impact of COVID-19 super-spreaders. Genome Res 30: 1434-1448.
Gómez-Carballa A, Bello X, Pardo-Seco J, Pérez Del Molino ML, Martinón-Torres F, Salas A. 2020b. Phylogeography of SARS-CoV-2 pandemic in Spain: a story of multiple introductions, micro-geographic stratification, founder effects, and super-spreaders. Zool Res 41: 605-620.
Gomez-Carballa A, Martinon-Torres F, Salas A. 2022a. Is SARS-CoV-2 an oncogenic virus? J Infectdoi:10.1016/j.jinf.2022.08.005.
Gomez-Carballa A, Pardo-Seco J, Bello X, Martinon-Torres F, Salas A. 2021. Superspreading in the emergence of COVID-19 variants. Trends Genet 37: 1069-1080.
Gomez-Carballa A, Pardo-Seco J, Pischedda S, Rivero-Calle I, Butler-Laporte G, Richards JB, Viz-Lasheras S, Martinon-Torres F, Salas A, network G. 2022b. Sex-biased expression of the TLR7 gene in severe COVID-19 patients: Insights from transcriptomics and epigenomics. Environ Res 215: 114288.
Gómez-Carballa A, Rivero-Calle I, Pardo-Seco J, Gómez-Rial J, Rivero-Velasco C, Rodriguez-Nunez N, Barbeito-Castineiras G, Pérez-Freixo H, Cebey-López M, Barral-Arca R et al. 2022. A multi-tissue study of immune gene expression profiling highlights the key role of the nasal epithelium in COVID-19 severity. Environ Res 210: 112890.
Gomez-Rial J, Curras-Tuala MJ, Rivero-Calle I, Gomez-Carballa A, Cebey-Lopez M, Rodriguez-Tenreiro C, Dacosta-Urbieta A, Rivero-Velasco C, Rodriguez-Nunez N, Trastoy-Pena R et al. 2020a. Increased Serum Levels of sCD14 and sCD163 Indicate a Preponderant Role for Monocytes in COVID-19 Immunopathology. Frontiers in immunology 11: 560381.
Gomez-Rial J, Rivero-Calle I, Salas A, Martinon-Torres F. 2020b. Role of Monocytes/Macrophages in Covid-19 Pathogenesis: Implications for Therapy. Infect Drug Resist 13: 2485-2493.
Jackson H, Rivero-Calle I, Broderick C, Habgood‑Coote D, D’Souza G, Nichols S, Vito O, Gómez‑Rial J, Rivero‑Velasco C, Rodríguez‑Núñez N et al. 2022. Characterisation of the blood RNA host response underpinning severity in COVID‑19 patients. Sci Rep 12: 12216.
Pardo-Seco J, Gomez-Carballa A, Bello X, Martinon-Torres F, Salas A. 2021. Pitfalls of barcodes in the study of worldwide SARS-CoV-2 variation and phylodynamics. Zool Res 42: 87-93.
Salas A, Bello X, Pardo-Seco J, Martinón-Torres F, Gómez-Carballa A. 2021. Superspreading: The engine of the SARS-CoV-2 pandemic. Sciencehttps://science.sciencemag.org/content/early/2020/12/09/science.abe3261/tab-e-letters.
Antonio Salas - reportaje Fundación QUAES: "SARS-CoV-2 y el gran experimento global"

COVID19hg

We are partners with our GEN-COVID project in the macro-project COVID19hg (see partners here).

[GenCovidHP image]

Coming soon:

Butler-Laporte et al. (2022). Exome-wide association study to identify rare variants influencing COVID-19 outcomes: Results from the Host Genetics Initiative. In press

Agreements with the industry

Also running some collaboration and agreement with the industry. More information hopefully soon!!

GenPoB on the news in regards to COVID-19

A non-updated list of links covering our role in the media during the pandemic (basically, the period 2020-2021)

Please, visit the section "News" for more updated information in this regard.

Los gemelos: una posible respuesta genética al coronavirus. Click
Trazan el árbol genealógico del virus con todos sus «descendientes» por el mundo. Click (if you do not have access try here)
On the radio - CRTVG: go to min 19

NEWS!! In regards to our article:The impact of super-spreaders in COVID-19: mapping genome variation worldwide

See metric to our article here

National press

EFE noticias: Antonio Salas (genetista): Saber más de supercontagiadores e invertir en ciencia es decisivo
El País (24 May; 2020; Daniel Mediavila): El misterio de los ‘supercontagiadores’ del coronavirus
ABC (21 May; 2020): Una investigación gallega afirma que entre el 33% y el 50% de los positivos estarían relacionados con 'supercontagiadores'
El Mundo (Pilar Pérez; 26 May, 2020): 'Supercontagiadores' y con una cepa diferente al resto de Europa, así es la epidemia española
El Mundo (Pilar Pérez; 15 Jully, 2020) Los neumólogos advierten de que España puede enfrentarse a una segunda ola "significativa" de Covid-19
La Vanguardia (Anxo Lugilde; 1 June; 2016): B3a, el coronavirus español
La Vanguardia (Ana Martinez; 29 May, 2020): Genetista: Saber más de supercontagiadores e invertir en ciencia es decisivo
Eldiario.es (21 May; 2020): La Universidad de Santiago vincula a los supercontagiadores con hasta la mitad de los casos de coronavirus
Niusdiario (30 May; 2020): El supercontagio en esta pandemia podría ser una buena noticia
Niusdiario (11 June; 2020): "Antonio Salas, experto en Genética: "Ninguna evidencia indica que el coronavirus esté perdiendo virulencia”. Interview by José Luis Fuentecilla
EURONEWS: Radiografía de los 'supercontagiadores' responsables del 50% de contagios de COVID-19
Tuotrodiario (29 May; 2020; Elena Sanz Bartolomé): Así son los supercontagiadores, una de las claves para explicar la pandemia del coronavirus
COPE (21 May; 2020; Iñigo Landa): Detectada en España una cepa del coronavirus que apenas afectó a otros países
Redacción Médica (21 May; 2020): Coronavirus: el 50% de los positivos tienen origen en un 'supercontagiador'
Diario Médico: Los supercontagiadores serían responsables de más de un tercio de los casos de Covid-19
20minutos (21 May; 2020): Investigadores de la USC vinculan entre un tercio y la mitad de los contagios de COVID a los 'supercontagiadores'
Servicio de Información y Noticias Científicas (Fundación Española para la Ciencia y la Tecnología) - SINC (Mónica G. Salomé): El supercontagio en esta pandemia podría ser una buena noticia

Regional press

La Voz de Galicia (Mila Méndez; 22 May, 2020): Descubren a los «supercontagiadores»: así son los responsables de cerca de la mitad de las infecciones por coronavirus
La Opinión (Mar Mato; 22 May, 2020): Científicos gallegos prueban la existencia de "supercontagiadores" del coronavirus
Faro de Vigo: Investigadores gallegos detectan en España una cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
Faro de Vigo (Mar Mato, El terreno incógnito del coronavirus: interview 27 July, 2020); pdf.
El Correo Gallego: Investigadores gallegos atribuyen a los “supercontagiadores” entre un tercio y la mitad de infectados por covid-19 en el mundo
El Correo Gallego (29 May; 2020): “Saber más de supercontagiadores e invertir en ciencia es decisivo”
El Correo Gallego: Hallan ‘supercontagiadores’ de casi la mitad de las personas infectadas
El Correo Gallego: Hallazgo clave con sello compostelano en la lucha contra el viru
EsGalicia: Hallan ‘supercontagiadores’ de casi la mitad de las personas infectadas
Diario SUR (25 May; 2020): Los 'supercontagiadores' del Covid-19: pocos y asintomáticos
Diario de Sevilla: (31 May; 2020): Qué son los supercontagiadores del coronavirus
SAS Madrid: Antonio Salas, experto en genética: "El comportamiento de este coronavirus solo se puede explicar por la figura del 'supercontagiador"
Europapress: Investigadores de la USC vinculan entre un tercio y la mitad de los contagios de COVID a los 'supercontagiadores'
Heraldo: Investigadores detectan en España una cepa que apenas afectó a otros países
CórdobaBN: Identifican el rasgo genético de los "supercontagiadores": Personas con mayor capacidad para contagiar el COVID-19
AS (21 May; 2020): La 'cepa asiática' del coronavirus que también entró en España
La Opinión de Málaga (21 May; 2020): Un grupo de investigadores detecta en España una "cepa asiática" del coronavirus que apenas afectó a otros países
El Progreso: Vinculan entre un tercio y la mitad de casos de Covid-19 a los 'supercontagiadores'
El Comercio (21 May; 2020): Investigadores detectan en España una cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
AlianzaNews (21 May; 2020): Detectan en España una cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
DiarioLibre (21 May; 2020):Detectan en España cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
InfoBae (21 May; 2020): Detectan en España una cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
Teleprensa (21 May; 2020): Investigadores de la USC vinculan entre un tercio y la mitad de los contagios de COVID a los 'supercontagiadores'
Crónica Balear (21 May; 2020):Investigadores detectan en España una cepa de coronavirus que apenas afectó a otros países
21Noticias (21 May; 2020): Entre un tercio y la mitad de los contagios por COVID-19 estarían relacionados con la figura de ‘súper-contagiadores’
Salamanca Al Día (21 May; 2020): Investigadores españoles vinculan entre un tercio y la mitad de los contagios de Covid a los ‘supercontagiadores’
Actualidad.RT (21 May; 2020): ¿Qué son los 'supercontagiadores'? Genetistas españoles detectan un tipo de individuo responsable de casi la mitad de los contagios de coronavirus
Levante (21 May; 2020): La cepa que eligió España para infectar
La Opinión de Zamora (21 May; 2020):
El Mañana (24 May; 2020): El misterio de los 'super-contagiadores' del coronavirus
Mundo Deportivo (1 June; 2020): Los supercontagiadores del coronavirus
Compostela24horas: Investigadores de la USC vinculan entre un tercio y la mitad de los contagios de COVID a los 'supercontagiadores'
La Nueva España: Un grupo de investigadores detecta en España una "cepa asiática" del coronavirus que apenas afectó a otros países
El periódico de Canarias ()21 May; 2020): Investigadores detectan en España una cepa que apenas afectó a otros países
Catalunya Vanguardista: El supercontagio podría ser una buena noticia

Internacional press

CLARIN: Estudio de los infectados (Argentina). Científicos españoles revelaron la existencia de “supercontagiadores” de coronavirus
Diario PERFIL: La figura del 'supercontagiador' juega un rol clave en esta pandemia
Tiempo Argentina Beta: Supercontagiadores: el riesgo sanitario que puede generar un solo anticuarentena
Peru Bicentenario (Peru): Descubren a los ‘supercontagiadores’ de covid-19, genetistas detectan el tipo responsable de casi la mitad de los contagios
Montevideo Portal: Los “supercontagiadores”: existen y explican hasta la mitad de los casos de COVID-19
Venezuela News (Venezuela): CORONAVIRUS CAMBIOS - Antonio Salas (genetista): Saber más de supercontagiadores e invertir en ciencia es decisivo
La República (Peru): ‘Supercontagiadores’, responsables de casi el 50 % de casos de COVID-19 en el mundo, según estudio
lv16.com (Argentina): Científicos españoles revelaron la existencia de “supercontagiadores” de coronavirus
TeleAmazonas (Ecuador): ¿Qué son los ‘supercontagiadores’?
Rivera mi Ciudad: ¿Qué son los 'supercontagiadores'? Se detectan un tipo de individuo responsable de casi la mitad de los contagios de coronavirus
Observador (Portugal): "Supercontagiadores" podem ser responsáveis por cerca de metade dos casos de Covid-19
Público (Portugal): Supercontagiadores podem infectar dezenas de pessoas. O que se sabe sobre eles?

On TV

Televisión Española (TVE): Entre el 33 y el 50% de las infecciones de Covid-19 podrían provenir de los "supercontagiadores"
Televisión de Galicia (TVG): Telexornal serán
Tele5: Dos españoles a la caza de supercontagiadores: la carga viral del sudor y los genes pueden ser claves
Trece TV: Trece al Día

Radio

Las Mañanas con Daniel Bermejo de Radio Nacional de España (RNE)
RTVE: Dos trillones de átomos con David Sierra; 31 May; 2020
Efervescencia con Manuel Vicente; 28 May; 2020
Redacción13 (COPE): Antonio Salas, genetista: "Será difícil el desarrollo de una vacuna universal"
esRadio: Investigadores de la USC vinculan hasta la mitad de los contagios de covid a los 'supercontagiadores'
ONDA CERO - con Julia Otero: Julia en la Onda; also here
SER - Aquí amb Josep Cuní:El supercontagiador transamite el virus por encima de la media
CanalSur Radio - La Mañana de Andalucía con Jesús Vigorra; 2 June; 2020
Radio Ribadavia (Argentina; 8 Jun 2020) by Fernándo Carnota
Edición Abierta (Argentina; 10 Jun, 2020) by Alberto Trombetta: Estado de situacíon
Radio con vos con Sebastián Davidovsky and Paloma Bokser; "Quienes son los supercontagiadores"; 18 June, 2020.
Radio Metro con María O Donnell: De acá en Más- Hablamos con Antonio Salas, experto en genética y profesor de la Facultad de Medicina de Santiago de Compostela, sobre los supercontagiadores; 19 June, 2020

Science magazines

GCIENCIA (by Manolo Rey): Supercontaxiadores da Covid-19: esta é a clave que revelan científicos galegos
GCIENCIA (by Manolo Rey): Así se reconstruíu desde Santiago o avance do SARS-CoV-2 polo planeta
VOZPOPULI (Antonio Martinez Ron): Por qué el ‘fuego’ de la pandemia no prendió igual en todas partes
National Geographic: El supercontagio en esta pandemia podría ser una buena noticia
Muy Interesante (by Victoria González): COVID-19: ¿existen los supercontagiadores?

Facebook

Ebiotec - Eurospes Biotecnologia S.A.

Other related interviews

La Voz de Galicia (2 October, 2020): La herencia genética de los neandertales influye en la mayor gravedad del covid-19

Los Angeles Times (1st October, 2020): A mini-interview by Shashank Bengali in regards to a paper in Science on super-spreaders in India nicely covered by Shashank: "Largest study of COVID-19 transmission highlights essential role of super-spreaders"